Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFSWAPQ12872 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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