Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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