Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFEMP1Q12805 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFEMP1Q12805 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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