Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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