Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SREBF2Q12772 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF2Q12772 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF2Q12772 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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