Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
HMGXB3Q12766 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
HMGXB3Q12766 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HMGXB3Q12766 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
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