Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 ABP140YOR239W 1887 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 YGR051CYGR051C 324 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 COQ5YML110C 924 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 NIS1YNL078W 1224 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 ASI2YNL159C 870 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 YOR203WYOR203W 354 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 LTV1YKL143W 1392 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 SSL1YLR005W 1386 nt3.59□□□□□ -1.83
NMD4Q12129 RPO21YDL140C 5202 nt3.59□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 THR4YCR053W 1545 nt3.59□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 NNF1YJR112W 606 nt3.58□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.58□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YBL028CYBL028C 321 nt3.58□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 GRX5YPL059W 453 nt3.58□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YCR099CYCR099C 468 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 CWC2YDL209C 1020 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YDR149CYDR149C 708 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 IES6YEL044W 501 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YGL140CYGL140C 3660 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 AVT7YIL088C 1473 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YJR096WYJR096W 849 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 IDP2YLR174W 1239 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 RPA43YOR340C 981 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.57□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 IOC2YLR095C 2439 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 HCA4YJL033W 2313 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 ELM1YKL048C 1923 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 ITT1YML068W 1395 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 KRE5YOR336W 4098 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 AI3Q0060 1248 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 HTA1YDR225W 399 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 GRX2YDR513W 432 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YEL075CYEL075C 369 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 MIG2YGL209W 1149 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 PDX1YGR193C 1233 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 IKI1YHR187W 930 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 CTK2YJL006C 972 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 PCD1YLR151C 1023 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 NNT1YLR285W 786 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 MER1YNL210W 813 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 COP1YDL145C 3606 nt3.56□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 TOP1YOL006C 2310 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 XRN1YGL173C 4587 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 CLB3YDL155W 1284 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 TVP15YDR100W 432 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 OTU1YFL044C 906 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 COG7YGL005C 840 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 ERG20YJL167W 1059 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 IES3YLR052W 753 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 OCA2YNL056W 594 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YNR062CYNR062C 984 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 OSW1YOR255W 837 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 POL30YBR088C 777 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 MCM7YBR202W 2538 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 CCM1YGR150C 2595 nt3.55□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 VPS9YML097C 1356 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 ARG2YJL071W 1725 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 SPT2YER161C 1002 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 RPS0AYGR214W 759 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 GPX1YKL026C 504 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YLR400WYLR400W 474 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YPL088WYPL088W 1029 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 snR17asnR17a 333 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 RDS1YCR106W 2499 nt3.54□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 IRC3YDR332W 2070 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YPR003CYPR003C 2265 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 MAM1YER106W 909 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 SEC4YFL005W 648 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 SPO11YHL022C 1197 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YLL037WYLL037W 381 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 SPR2YOR214C 711 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 CIN2YPL241C 807 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 DUN1YDL101C 1542 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 REB1YBR049C 2433 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 SEC15YGL233W 2733 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 YGR237CYGR237C 2358 nt3.53□□□□□ -1.84
NMD4Q12129 CDC45YLR103C 1953 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SPT6YGR116W 4356 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ECM16YMR128W 3804 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 PIG2YIL045W 1617 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YLR177WYLR177W 1887 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RIM4YHL024W 2142 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YDL158CYDL158C 309 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 ATC1YDR184C 885 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 MFA1YDR461W 111 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 SEC53YFL045C 765 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 LSM1YJL124C 519 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YJL175WYJL175W 513 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 COX19YLL018C-A 297 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 HMX1YLR205C 954 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YOR238WYOR238W 912 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RFC5YBR087W 1065 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 YBR090CYBR090C 369 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 MED8YBR193C 672 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 FYV5YCL058C 459 nt3.52□□□□□ -1.85
NMD4Q12129 RPL13AYDL082W 600 nt3.51□□□□□ -1.85
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