Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F3Q08477 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYP4F3Q08477 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms