Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LRP1Q07954 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms