Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCL9Q07325 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXCL9Q07325 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms