Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL16A1Q07092 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL16A1Q07092 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL16A1Q07092 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms