Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD51Q06609 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms