Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1T1Q06455 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1T1Q06455 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms