Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDSRQ06136 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDSRQ06136 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms