Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN12Q05209 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms