Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE3AQ05086 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE3AQ05086 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms