Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 REC102YLR329W 795 nt2.78□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 PFK27YOL136C 1194 nt2.78□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 snR42snR42 351 nt2.78□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 MTL1YGR023W 1656 nt2.78□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 LRG1YDL240W 3054 nt2.78□□□□□ -1.96
YMR226CQ05016 ITT1YML068W 1395 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 NET1YJL076W 3570 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YDR491CYDR491C 492 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 FMP32YFL046W 624 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 AGE2YIL044C 897 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YJL175WYJL175W 513 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YLR230WYLR230W 306 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 NDL1YLR254C 570 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YMR310CYMR310C 954 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YNL184CYNL184C 327 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 SUR1YPL057C 1149 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 GYP7YDL234C 2241 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 CBP2YHL038C 1893 nt2.77□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YIL169CYIL169C 2988 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 NDT80YHR124W 1884 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 DTD1YDL219W 453 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 AST2YER101C 1293 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MRPS35YGR165W 1038 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 COX23YHR116W 456 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 AIM26YKL037W 357 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 FRE2YKL220C 2136 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 SPS4YOR313C 1017 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YPR027CYPR027C 834 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MRS2YOR334W 1413 nt2.76□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 TPO5YKL174C 1857 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 FAA2YER015W 2235 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 ERP3YDL018C 678 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 PMI40YER003C 1290 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 AIM11YER093C-A 414 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YIL089WYIL089W 618 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YIL174WYIL174W 228 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MCA1YOR197W 1299 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YPR078CYPR078C 1119 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 RSN1YMR266W 2862 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MED1YPR070W 1701 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 SWC4YGR002C 1431 nt2.75□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 TRM12YML005W 1389 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YOR365CYOR365C 2112 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 PFF1YBR074W 2931 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 LSM6YDR378C 261 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 DOG1YHR044C 741 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 RPS22AYJL190C 393 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 RSM26YJR101W 801 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 PIR1YKL164C 1026 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 REX3YLR107W 1215 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 RCE1YMR274C 948 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 SYC1YOR179C 567 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 SRP68YPL243W 1800 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 HUL5YGL141W 2733 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 VIP1YLR410W 3441 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 ILS1YBL076C 3219 nt2.74□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 ABD1YBR236C 1311 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 TAO3YIL129C 7131 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 PAU13YHL046C 363 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 SNX4YJL036W 1272 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 ATG27YJL178C 816 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MAK16YAL025C 921 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YKR033CYKR033C 426 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MRPS17YMR188C 714 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 snR11snR11 258 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 RPL33AYPL143W 324 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MRP2YPR166C 348 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 ARO4YBR249C 1113 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YCG1YDR325W 3108 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 TAF2YCR042C 4224 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 DSE4YNR067C 3354 nt2.73□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MRH1YDR033W 963 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MSS4YDR208W 2340 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 HTA1YDR225W 399 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YGR039WYGR039W 312 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 MNT3YIL014W 1893 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 ATP11YNL315C 957 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YOR062CYOR062C 807 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YPR050CYPR050C 414 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 YPR203WYPR203W 309 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 SAP1YER047C 2694 nt2.72□□□□□ -1.97
YMR226CQ05016 PSK1YAL017W 4071 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 RIX1YHR197W 2292 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 PCL9YDL179W 915 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 RTN1YDR233C 888 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YGL152CYGL152C 678 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 EPT1YHR123W 1176 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 CPR7YJR032W 1182 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YLR076CYLR076C 423 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 INP1YMR204C 1263 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 YPL035CYPL035C 348 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 MON1YGL124C 1935 nt2.71□□□□□ -1.98
YMR226CQ05016 NSA1YGL111W 1392 nt2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms