Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	BAR1	YIL015W	1764 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YNR066C	YNR066C	1311 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YCR016W	YCR016W	873 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PPH3	YDR075W	927 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	FRQ1	YDR373W	573 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	MIG3	YER028C	1185 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	ATG34	YOL083W	1239 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RPS12	YOR369C	432 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	MIG1	YGL035C	1515 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	TEC1	YBR083W	1461 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	FRE4	YNR060W	2160 nt		3.78	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	TGL2	YDR058C	981 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PLP1	YDR183W	693 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SPT15	YER148W	723 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	GEP4	YHR100C	558 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	CAP2	YIL034C	864 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SNX4	YJL036W	1272 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SUP45	YBR143C	1314 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	TOP1	YOL006C	2310 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	URA2	YJL130C	6645 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	LRS4	YDR439W	1044 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YDR535C	YDR535C	501 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SPT2	YER161C	1002 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SOP4	YJL192C	705 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	TEM1	YML064C	738 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	COX14	YML129C	213 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	IZH2	YOL002C	954 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YPL035C	YPL035C	348 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PNG1	YPL096W	1092 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	CPA2	YJR109C	3357 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PIN4	YBL051C	2007 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	UBP5	YER144C	2418 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	CGR1	YGL029W	363 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	RPS25A	YGR027C	327 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YGR064W	YGR064W	369 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PPX1	YHR201C	1194 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	EMC2	YJR088C	879 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YOR022C	YOR022C	2148 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	RAS1	YOR101W	930 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PRM4	YPL156C	855 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	CCL1	YPR025C	1182 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	ERV15	YBR210W	429 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YBR292C	YBR292C	372 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	MSM1	YGR171C	1728 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	RAD26	YJR035W	3258 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	ARG2	YJL071W	1725 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	LSM1	YJL124C	519 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PCD1	YLR151C	1023 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	GSP1	YLR293C	660 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	TPK2	YPL203W	1143 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SHR3	YDL212W	633 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	GIC2	YDR309C	1152 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	TCA17	YEL048C	459 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PTI1	YGR156W	1278 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	MPC3	YGR243W	441 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	FYV6	YNL133C	522 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YBR013C	YBR013C	390 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PHO88	YBR106W	567 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	CCM1	YGR150C	2595 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	DET1	YDR051C	1005 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	MEI4	YER044C-A	1227 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YIL161W	YIL161W	708 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	VPS25	YJR102C	609 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YAL034C-B	YAL034C-B	354 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SWD2	YKL018W	990 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	MYO3	YKL129C	3819 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YLR198C	YLR198C	360 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YLR416C	YLR416C	399 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YML094C-A	YML094C-A	402 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	MCT1	YOR221C	1083 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	ATP25	YMR098C	1839 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	YME2	YMR302C	2553 nt		3.71	□□□□□ -1.81
SYF1	Q04048	PRP22	YER013W	3438 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	SNU23	YDL098C	585 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YGL177W	YGL177W	348 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	HTD2	YHR067W	843 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	AIM23	YJL131C	1071 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PIR1	YKL164C	1026 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YMR087W	YMR087W	855 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ITT1	YML068W	1395 nt		3.71	□□□□□ -1.82

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