Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ERCC6Q03468 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms