Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TOP2BQ02880 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms