Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUCB1Q02818 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms