Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT1Q02742 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms