Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB1Q02641 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms