Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 MRS2YOR334W 1413 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 PFF1YBR074W 2931 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 ERP3YDL018C 678 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 RPL19BYBL027W 570 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 MDJ2YNL328C 441 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 HNT3YOR258W 654 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 PNT1YOR266W 1272 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 RIX1YHR197W 2292 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 PPH3YDR075W 927 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 PEF1YGR058W 1008 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 CPR7YJR032W 1182 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 AAH1YNL141W 1044 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 RPL33AYPL143W 324 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 PMS1YNL082W 2622 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 TLC1TLC1 1301 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 YKL222CYKL222C 2118 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 KIN82YCR091W 2163 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 NSA1YGL111W 1392 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 CTF18YMR078C 2226 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 SWC4YGR002C 1431 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 SMC2YFR031C 3513 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 DIA2YOR080W 2199 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 YDR161WYDR161W 1164 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 CGR1YGL029W 363 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 NDL1YLR254C 570 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP49Q02199 MTL1YGR023W 1656 nt2.59□□□□□ -2
NUP49Q02199 ECM21YBL101C 3354 nt2.59□□□□□ -2
NUP49Q02199 AXL1YPR122W 3627 nt2.59□□□□□ -2
NUP49Q02199 MIP6YHR015W 1980 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 GRX2YDR513W 432 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 YGR160WYGR160W 612 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 YKR033CYKR033C 426 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 SMA2YML066C 1110 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 ATP11YNL315C 957 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 MCA1YOR197W 1299 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 TPK2YPL203W 1143 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 SAP1YER047C 2694 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 SOK1YDR006C 2706 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 YPL109CYPL109C 1974 nt2.58□□□□□ -2
NUP49Q02199 VAC14YLR386W 2643 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 FIN1YDR130C 876 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 YGR026WYGR026W 837 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 SFH5YJL145W 885 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 TEM1YML064C 738 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 YNL109WYNL109W 546 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 RSM19YNR037C 276 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 AIM41YOR215C 558 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 YPR027CYPR027C 834 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 CTK1YKL139W 1587 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 PAM1YDR251W 2493 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 FLO11YIR019C 4104 nt2.57□□□□□ -2
NUP49Q02199 CYR1YJL005W 6081 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 YDR340WYDR340W 303 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 YIP5YGL161C 933 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 MTM1YGR257C 1101 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 EFG1YGR271C-A 702 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 RPL14BYHL001W 417 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 CFD1YIL003W 882 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 REC102YLR329W 795 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 ILV5YLR355C 1188 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 RPL20AYMR242C 519 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 RCE1YMR274C 948 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 YPR203WYPR203W 309 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 YHL012WYHL012W 1482 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 SEC59YMR013C 1560 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 POL3YDL102W 3294 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 MMS1YPR164W 4224 nt2.56□□□□□ -2
NUP49Q02199 YME2YMR302C 2553 nt2.55□□□□□ -2
NUP49Q02199 YDR193WYDR193W 399 nt2.55□□□□□ -2
NUP49Q02199 PFY1YOR122C 381 nt2.55□□□□□ -2
NUP49Q02199 HSH49YOR319W 642 nt2.55□□□□□ -2
NUP49Q02199 HMT1YBR034C 1047 nt2.55□□□□□ -2
NUP49Q02199 SLI1YGR212W 1407 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 MPC54YOR177C 1395 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 MSB2YGR014W 3921 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 THO1YER063W 657 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 RPL23BYER117W 414 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 RPL24BYGR148C 468 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 YLL037WYLL037W 381 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 APC9YLR102C 798 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 SRB8YCR081W 4284 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 SKT5YBL061C 2091 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 BNR1YIL159W 4128 nt2.54□□□□□ -2
NUP49Q02199 JSN1YJR091C 3276 nt2.53□□□□□ -2
NUP49Q02199 SYS1YJL004C 612 nt2.53□□□□□ -2
NUP49Q02199 YLR012CYLR012C 300 nt2.53□□□□□ -2
NUP49Q02199 RNH203YLR154C 333 nt2.53□□□□□ -2
NUP49Q02199 JIP3YLR331C 378 nt2.53□□□□□ -2
NUP49Q02199 RIM9YMR063W 720 nt2.53□□□□□ -2
NUP49Q02199 SRP68YPL243W 1800 nt2.53□□□□□ -2
NUP49Q02199 SRO77YBL106C 3033 nt2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.6 ms