Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN7AQ01118 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN7AQ01118 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms