Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4GALNT1Q00973 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4GALNT1Q00973 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms