Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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FAM3AP98173 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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