Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAE1P78406 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAE1P78406 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAE1P78406 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAE1P78406 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAE1P78406 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAE1P78406 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAE1P78406 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAE1P78406 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAE1P78406 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAE1P78406 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAE1P78406 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAE1P78406 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms