Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HBBP68871 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HBBP68871 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HBBP68871 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HBBP68871 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HBBP68871 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HBBP68871 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms