Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-24P63145 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-24P63145 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms