Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBA52P62987 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms