Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNG7P62955 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CACNG7P62955 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms