Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GNB1P62873 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB1P62873 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB1P62873 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GNB1P62873 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GNB1P62873 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms