Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL23P62829 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL23P62829 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL23P62829 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL23P62829 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL23P62829 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms