Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP46P62068 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP46P62068 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP46P62068 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP46P62068 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP46P62068 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP46P62068 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP46P62068 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP46P62068 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP46P62068 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP46P62068 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP46P62068 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms