Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO2P61956 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO2P61956 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms