Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS2P61201 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS2P61201 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS2P61201 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS2P61201 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS2P61201 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS2P61201 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS2P61201 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPS2P61201 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS2P61201 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS2P61201 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS2P61201 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS2P61201 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS2P61201 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPS2P61201 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPS2P61201 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS2P61201 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPS2P61201 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS2P61201 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS2P61201 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS2P61201 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS2P61201 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS2P61201 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS2P61201 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPS2P61201 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms