Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTBP60709 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTBP60709 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTBP60709 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTBP60709 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms