Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFRD-1P60508 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms