Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFB1P60022 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFB1P60022 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms