Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms