Protein–RNA interactions for Protein: P59901

LILRA4, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA4P59901 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LILRA4P59901 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms