Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms