Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB25P57735 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB25P57735 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms