Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN12P56749 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms