Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX3P56589 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX3P56589 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX3P56589 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX3P56589 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX3P56589 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX3P56589 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PEX3P56589 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX3P56589 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX3P56589 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX3P56589 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX3P56589 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms