Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CASP9P55211 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP9P55211 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP9P55211 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP9P55211 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP9P55211 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms