Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms