Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGDP52209 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGDP52209 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGDP52209 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGDP52209 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGDP52209 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGDP52209 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGDP52209 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms