Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP5P51878 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP5P51878 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP5P51878 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP5P51878 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP5P51878 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP5P51878 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP5P51878 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP5P51878 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP5P51878 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP5P51878 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP5P51878 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms